Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9V4

Rsph9, Radial spoke head protein 9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph9Q9D9V4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rsph9Q9D9V4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rsph9Q9D9V4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms