Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS72

Filip1, Filamin-A-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Filip1Q9CS72 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Filip1Q9CS72 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms