Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ttc29Q80VM3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms