Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS58

Clec4b1, Antigen presenting cell lectin-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b1Q7TS58 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clec4b1Q7TS58 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms