Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rhox8Q6VSS7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms