Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USPL1Q5W0Q7 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms