Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms