Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LbrQ3U9G9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms