Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUL7

Dcaf17, DDB1- and CUL4-associated factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcaf17Q3TUL7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dcaf17Q3TUL7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dcaf17Q3TUL7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dcaf17Q3TUL7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dcaf17Q3TUL7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dcaf17Q3TUL7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dcaf17Q3TUL7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Dcaf17Q3TUL7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Dcaf17Q3TUL7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Dcaf17Q3TUL7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Dcaf17Q3TUL7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Dcaf17Q3TUL7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dcaf17Q3TUL7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms