Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms