Protein–RNA interactions for Protein: P41241

Csk, Tyrosine-protein kinase CSK, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CskP41241 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CskP41241 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CskP41241 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CskP41241 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CskP41241 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CskP41241 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CskP41241 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CskP41241 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CskP41241 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CskP41241 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CskP41241 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CskP41241 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CskP41241 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CskP41241 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CskP41241 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CskP41241 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CskP41241 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CskP41241 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CskP41241 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CskP41241 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CskP41241 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CskP41241 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CskP41241 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CskP41241 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CskP41241 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CskP41241 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CskP41241 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CskP41241 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CskP41241 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CskP41241 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CskP41241 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CskP41241 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CskP41241 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CskP41241 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CskP41241 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CskP41241 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CskP41241 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CskP41241 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CskP41241 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CskP41241 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CskP41241 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CskP41241 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CskP41241 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CskP41241 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CskP41241 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CskP41241 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CskP41241 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CskP41241 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CskP41241 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CskP41241 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CskP41241 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CskP41241 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CskP41241 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CskP41241 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CskP41241 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CskP41241 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CskP41241 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CskP41241 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CskP41241 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CskP41241 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CskP41241 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CskP41241 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CskP41241 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CskP41241 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CskP41241 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CskP41241 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CskP41241 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CskP41241 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CskP41241 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CskP41241 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CskP41241 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CskP41241 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CskP41241 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CskP41241 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CskP41241 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CskP41241 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CskP41241 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CskP41241 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CskP41241 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CskP41241 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CskP41241 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CskP41241 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CskP41241 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CskP41241 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CskP41241 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CskP41241 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CskP41241 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CskP41241 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CskP41241 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CskP41241 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CskP41241 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CskP41241 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CskP41241 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CskP41241 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CskP41241 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CskP41241 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CskP41241 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CskP41241 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CskP41241 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CskP41241 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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