Protein–RNA interactions for Protein: P28293

Ctsg, Cathepsin G, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsgP28293 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtsgP28293 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsgP28293 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsgP28293 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms