Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChgaP26339 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChgaP26339 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChgaP26339 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChgaP26339 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChgaP26339 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChgaP26339 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChgaP26339 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChgaP26339 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChgaP26339 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChgaP26339 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms