Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Defa-rs1P17533 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Defa-rs1P17533 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Defa-rs1P17533 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Defa-rs1P17533 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Defa-rs1P17533 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Defa-rs1P17533 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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