Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppfibp2O35711 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ppfibp2O35711 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ppfibp2O35711 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ppfibp2O35711 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppfibp2O35711 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppfibp2O35711 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppfibp2O35711 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppfibp2O35711 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms