Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efna5O08543 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efna5O08543 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efna5O08543 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efna5O08543 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efna5O08543 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efna5O08543 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Efna5O08543 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efna5O08543 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efna5O08543 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efna5O08543 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efna5O08543 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efna5O08543 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efna5O08543 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efna5O08543 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efna5O08543 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efna5O08543 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efna5O08543 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efna5O08543 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efna5O08543 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efna5O08543 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Efna5O08543 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Efna5O08543 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Efna5O08543 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna5O08543 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna5O08543 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna5O08543 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna5O08543 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna5O08543 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna5O08543 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna5O08543 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna5O08543 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms