Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDGFL3Q9Y3E1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms