Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hmgn3Q9DCB1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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