Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PudpQ9D5U5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PudpQ9D5U5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PudpQ9D5U5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PudpQ9D5U5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PudpQ9D5U5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PudpQ9D5U5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PudpQ9D5U5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PudpQ9D5U5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PudpQ9D5U5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PudpQ9D5U5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PudpQ9D5U5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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