Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3P1

Tchhl1, Trichohyalin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tchhl1Q9D3P1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tchhl1Q9D3P1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tchhl1Q9D3P1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tchhl1Q9D3P1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tchhl1Q9D3P1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms