Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Pfdn1Q9CWM4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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