Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Ctu1Q99J10 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Ctu1Q99J10 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Ctu1Q99J10 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Ctu1Q99J10 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctu1Q99J10 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Ctu1Q99J10 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Ctu1Q99J10 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Ctu1Q99J10 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Ctu1Q99J10 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Ctu1Q99J10 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Ctu1Q99J10 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Ctu1Q99J10 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17■□□□□ 0.31
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Ctu1Q99J10 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctu1Q99J10 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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