Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PROM2Q8N271 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms