Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PolbQ8K409 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PolbQ8K409 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms