Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms