Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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D130052B06RikQ3UW13 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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D130052B06RikQ3UW13 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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D130052B06RikQ3UW13 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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D130052B06RikQ3UW13 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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D130052B06RikQ3UW13 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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D130052B06RikQ3UW13 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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D130052B06RikQ3UW13 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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D130052B06RikQ3UW13 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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D130052B06RikQ3UW13 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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D130052B06RikQ3UW13 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
D130052B06RikQ3UW13 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
D130052B06RikQ3UW13 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
D130052B06RikQ3UW13 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
D130052B06RikQ3UW13 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
D130052B06RikQ3UW13 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
D130052B06RikQ3UW13 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
D130052B06RikQ3UW13 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
D130052B06RikQ3UW13 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
D130052B06RikQ3UW13 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
D130052B06RikQ3UW13 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
D130052B06RikQ3UW13 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
D130052B06RikQ3UW13 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
D130052B06RikQ3UW13 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
D130052B06RikQ3UW13 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
D130052B06RikQ3UW13 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
D130052B06RikQ3UW13 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
D130052B06RikQ3UW13 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
D130052B06RikQ3UW13 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
D130052B06RikQ3UW13 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
D130052B06RikQ3UW13 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
D130052B06RikQ3UW13 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
D130052B06RikQ3UW13 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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