Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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SEC23BQ15437 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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SEC23BQ15437 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEC23BQ15437 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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SEC23BQ15437 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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SEC23BQ15437 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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SEC23BQ15437 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEC23BQ15437 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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