Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL4AQ13619 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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