Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNB3Q05901 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms