Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tuba4aP68368 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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