Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrbP28704 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrbP28704 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrbP28704 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrbP28704 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrbP28704 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrbP28704 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrbP28704 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrbP28704 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrbP28704 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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