Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMA1P25391 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms