Protein–RNA interactions for Protein: P0C8K7

Smim1, Small integral membrane protein 1, mousemouse

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Length 78 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim1P0C8K7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim1P0C8K7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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