Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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SOBPA7XYQ1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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SOBPA7XYQ1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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SOBPA7XYQ1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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