Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SUCLA2Q9P2R7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SUCLA2Q9P2R7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SUCLA2Q9P2R7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SUCLA2Q9P2R7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SUCLA2Q9P2R7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SUCLA2Q9P2R7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SUCLA2Q9P2R7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SUCLA2Q9P2R7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SUCLA2Q9P2R7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SUCLA2Q9P2R7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SUCLA2Q9P2R7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SUCLA2Q9P2R7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SUCLA2Q9P2R7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SUCLA2Q9P2R7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SUCLA2Q9P2R7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SUCLA2Q9P2R7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SUCLA2Q9P2R7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms