Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP35Q9P2H5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
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