Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUOX1Q9NRD9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms