Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssu72Q9CY97 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssu72Q9CY97 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms