Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 HACL1-206ENST00000435217 1269 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01821-202ENST00000438505 882 ntTSL 4 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001528.1-201ENST00000499504 1223 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 C15orf40-209ENST00000538348 561 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 Metazoa_SRP.12-201ENST00000553249 268 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms