Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms