Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncbQ91ZZ3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms