Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HECW1Q76N89 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms