Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUM4

ARHGAP27, Rho GTPase-activating protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP27Q6ZUM4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP27Q6ZUM4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms