Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifit1Q64282 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifit1Q64282 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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