Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sin3bQ62141 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms