Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SvipQ3UZP4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Bcl2l11-201ENSMUST00000019281 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 B230323A14Rik-201ENSMUST00000180488 2864 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Gm43589-201ENSMUST00000199400 1523 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Gm19967-201ENSMUST00000179676 2138 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SvipQ3UZP4 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms