Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdpd4Q3TT99 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gdpd4Q3TT99 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms