Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HSPB3Q12988 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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