Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC173Q0VFZ6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms