Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gata4Q08369 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms